CORTECT : service d’analyse de données de séquençage à haut débit (NGS) en mode SaaS

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05 Novembre 2015

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STIC Biologie / Santé

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Santé


CORTECT propose un service d’analyse de données de séquençage à haut débit (NGS) en mode SaaS, tout en un et sur-mesure, accessible, facilement interprétable et avec des performances inégalées 

 

Contexte
L’émergence récente d’une nouvelle génération de séquenceurs (NGS en anglais), dite à très haut débit, révolutionne la biologie cellulaire et moléculaire : le prix du séquençage est devenu très accessible et l’augmentation vertigineuse de la capacité de production de ces machines donne la possibilité de séquencer des génomes entiers en quelques jours, ouvrant ainsi la voie à une médecine personnalisée. Il est par exemple désormais possible de séquencer l’ensemble des informations contenues dans les cellules cancéreuses d’un patient afin de rechercher des marqueurs moléculaires qui serviront pour le diagnostic, le pronostic, le suivi de la maladie résiduelle ou la réponse au traitement.

Bénéfices
Les données de séquençage n’aboutissent pas directement à des résultats biologiques : elles sont complètement désorganisées, découpées en un puzzle de millions de mots. Biologistes et cliniciens sont ainsi confrontés à un déluge de données (Big Data) qu’il faut stocker, structurer et analyser car inexploitables en l’état. Des analyses bioinformatiques sont alors nécessaires pour réaliser un pont entre les lectures du séquenceur et le sens biologique de l’échantillon. Les solutions actuelles restent encore peu satisfaisantes. Les cliniciens et biologistes ont en effet besoin d’être autonomes, de pouvoir observer, comprendre, partager et annoter une analyse bioinformatique orientée sur des questions précises en biologie et en médecine. CORTECT ambitionne de répondre à ces besoins en fournissant des outils informatiques qui rendent accessible l’analyse des données.

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